Arten von Peptidbibliotheken

Alanine-Scan-Bibliothek
    Die Ala-Scanning-Peptidbibliothek ist eine Methode zur Identifizierung der Auswirkungen spezifischer Aminosäuren in einer Sequenz auf die Peptidfunktion. Wir ersetzen die Aminosäuren in der Sequenz nacheinander durch Ala; Mithilfe der Ala-Scanning-Peptidbibliothek kann der Einfluss spezifischer Aminosäuren auf die gesamte Proteinstruktur, -funktion und andere biologische Aktivitäten identifiziert werden.

Positionsscanbibliothek (PSL)
    Eine Positionsscan-Peptidbibliothek ist ein wichtiges Werkzeug zur Optimierung von Peptidsequenzen. Es ersetzt systematisch andere Aminosäuren für ausgewählte Regionen oder Stellen eines Peptids und bestimmt die optimalen Aminosäuren an diesen Stellen durch Peptidaktivitätstests. Diese Art von Peptidbibliothek hilft Forschern, bestimmte Regionen zu identifizieren, die an bestimmten Positionen bestimmte Wirkungen oder Aktivitäten haben.

Überlappende Bibliothek

Die überlappende Peptidbibliothek ist eine gängige Methode zum Screening linearer oder kontinuierlicher Epitope. Das Design der Peptidbibliothek wird hauptsächlich durch zwei Parameter bestimmt: Peptidlänge und Offset-Nummer. Da das Protein vom N-Terminus zum C-Terminus verkürzt ist, ist es möglich, dass am Ende ein Orphan-Peptid übrig bleibt. Um eine einheitliche Länge beizubehalten, empfehlen wir die Verschiebung einer oder mehrerer Aminosäuren vom N-Terminus.

Trunkierungspeptidbibliotheken

Trunkierungspeptidbibliotheken werden verwendet, um die kürzesten Aminosäuresequenzen innerhalb einer Peptidsequenz zu identifizieren. Bei der Konstruktion von Trunkierungspeptidbibliotheken werden typischerweise Aminosäuren an beiden Enden der ursprünglichen Peptidsequenz systematisch entfernt. Wenn bestimmte wichtige Aminosäuren bekannt sind, sollten diese Aminosäuren beibehalten werden. Anschließend werden die Aminosäuren einzeln vom anderen Ende des Peptids entfernt, um mit dem Screening zu beginnen.

Zufällige Peptidbibliothek

Zufällige Peptidbibliotheken werden mithilfe eines Shotgun-Ansatzes entworfen, um die 20 natürlichen Aminosäuren einzuschließen und gleichzeitig ausgewählte Aminosäurereste zufällig zu ersetzen.

Verschlüsselte Bibliothek

Das Design verschlüsselter Bibliotheken basiert auf internen Umlagerungen der ursprünglichen Peptidaminosäuresequenz. Es ist die Peptidbibliothek mit dem höchsten Mutationsgrad. Gestörte Peptide werden häufig als Negativkontrollen verwendet, um zu zeigen, dass bestimmte Sequenzen für die Proteinfunktion oder -aktivität entscheidend sind. Es handelt sich außerdem um ein zufälliges Screening-Tool zur Identifizierung neuer Ziele.