Was sind zellpenetrierende Peptide?

Zellpenetrierende Peptide sind kleine Peptide, die die Zellmembran leicht durchdringen können.Diese Molekülklasse, insbesondere CPPs mit Targeting-Funktionen, verspricht eine effiziente Arzneimittelabgabe an Zielzellen.

Daher hat die Forschung dazu eine gewisse biomedizinische Bedeutung.In dieser Studie wurden CPPs mit unterschiedlichen Transmembranaktivitäten auf Sequenzebene untersucht. Dabei wurde versucht, die Faktoren herauszufinden, die die Transmembranaktivität von CPPs beeinflussen, die Sequenzunterschiede zwischen CPPs mit unterschiedlichen Aktivitäten und NonCPPs zu ermitteln und eine Methode zur Analyse biologischer Sequenzen einzuführen.

CPPs- und NonCPPs-Sequenzen wurden aus der CPPsite-Datenbank und verschiedenen Literaturstellen abgerufen, und Transmembranpeptide (HCPPs, MCPPs, LCPPs) mit hoher, mittlerer und niedriger Transmembranaktivität wurden aus den CPPs-Sequenzen extrahiert, um Datensätze zu erstellen.Basierend auf diesen Datensätzen wurden folgende Studien durchgeführt:

1, Die Aminosäure- und Sekundärstrukturzusammensetzung verschiedener aktiver CPPs und NonCPPs wurden durch ANOVA analysiert.Es wurde festgestellt, dass die elektrostatischen und hydrophoben Wechselwirkungen von Aminosäuren eine wichtige Rolle bei der Transmembranaktivität von CPPs spielen und dass die helikale Struktur und die zufällige Windung auch die Transmembranaktivität von CPPs beeinflussten.

2. Die physikalischen und chemischen Eigenschaften und Längen von CPPs mit unterschiedlichen Aktivitäten wurden auf der zweidimensionalen Ebene dargestellt.Es wurde festgestellt, dass CPPs und NonCPPs mit unterschiedlichen Aktivitäten unter einigen speziellen Eigenschaften gruppiert werden können, und HCPPs, MCPPs, LCPPs und NonCPPs wurden in drei Cluster unterteilt, was ihre Unterschiede zeigt;

3. In diesem Artikel wird das Konzept des physikalischen und chemischen Schwerpunkts der biologischen Sequenz eingeführt. Die Reste, aus denen die Sequenz besteht, werden als Partikelpunkte betrachtet und die Sequenz wird als Partikelsystem für die Forschung abstrahiert.Diese Methode wurde auf die Analyse von CPPs angewendet, indem CPPs mit unterschiedlichen Aktivitäten mit der PCA-Methode auf die 3D-Ebene projiziert wurden. Es wurde festgestellt, dass die meisten CPPs zusammen gruppierten und einige LCPPs zusammen mit Nicht-CPPs gruppierten.

Diese Studie hat Auswirkungen auf das Design von CPPs und das Verständnis der Unterschiede in den Sequenzen von CPPs mit unterschiedlichen Aktivitäten.Darüber hinaus kann die in diesem Artikel vorgestellte Analysemethode des physikalischen und chemischen Schwerpunkts biologischer Sequenzen auch für die Analyse anderer biologischer Probleme verwendet werden.Gleichzeitig können sie als Eingabeparameter für einige biologische Klassifizierungsprobleme verwendet werden und spielen eine Rolle bei der Mustererkennung.


Zeitpunkt der Veröffentlichung: 15. Juni 2023